Este espacio, conocido a principios del siglo como La Alameda o Plaza Nueva, recibió en 1915 su nombre en memoria del general José Silverio Núñez, quien como segundo gobernador del estado, propuso en 1857 su creación y encargó el diseño al ingeniero Longinos Banda. Desafortunadamente la Guerra de Reforma impidió su terminación y el Jardín permaneció en el abandono. Al reiniciar los trabajos del jardín en 1863, se agregaron al proyecto original una barda perimetral con verjas de hierro forjado y sendos arcos de acceso en las esquinas. Existió en su centro un gran espejo de agua conocido como Fuente de los Patos que fue removido en 1931, al igual que las verjas de hierro. El Jardín fue sede de la tradicional Feria de Todos los Santos, llamada desde 1934 Feria Agrícola, Ganadera, Comercial e Industrial del Estado de Colima.
